Cái gọi là sinh thiết lỏng đánh giá các đột biến và những thay đổi khác trong DNA từ khối u vào máu.

Tín dụng: Jonathan Bailey / NHGRI

Trong nghiên cứu lớn nhất thuộc loại này cho đến nay, một xét nghiệm đánh giá các đột biến DNA và những thay đổi khác trong vật liệu di truyền được thải ra từ khối u vào máu—cái gọi là sinh thiết lỏng—tạo ra kết quả rất giống với kết quả của sinh thiết khối u truyền thống.

Các kiểu thay đổi bộ gen được xác định bằng xét nghiệm trong một bộ sưu tập lớn các mẫu máu của bệnh nhân phần lớn phù hợp với các kiểu thay đổi gen được thấy trong các nghiên cứu hồ sơ sinh thiết khối u lớn, các nhà nghiên cứu đã báo cáo vào tuần trước tại cuộc họp thường niên của Hiệp hội Ung thư lâm sàng Hoa Kỳ (ASCO) vào tuần trước. Chicago.

Và trong một nhóm gồm gần 400 bệnh nhân mắc một số loại ung thư phổ biến, trong hầu hết các trường hợp, xét nghiệm đã xác định các đột biến trong mẫu máu của bệnh nhân giống như đã thấy trong các mẫu sinh thiết khối u của họ. Sinh thiết lỏng cũng xác định các đột biến có liên quan đến kháng thuốc nhưng không được phát hiện trong sinh thiết mô ban đầu.

Điều tra viên học thuật hàng đầu của nghiên cứu, Tiến sĩ Philip Mack, thuộc Trung tâm Ung thư Toàn diện Davis của Đại học California, thừa nhận rằng vẫn còn nhiều việc phải làm để hiểu rõ hơn về cách sử dụng sinh thiết lỏng tốt nhất và vai trò cuối cùng của chúng đối với bệnh nhân. quan tâm.

Nhưng tại thời điểm này, dựa trên những phát hiện của nghiên cứu, ông cho biết bằng chứng cho thấy sinh thiết lỏng có thể là một giải pháp thay thế khi sinh thiết khối u truyền thống “không thực tế, không thể tiếp cận hoặc khả thi”.

Một cách dễ dàng hơn để có được thông tin tương tự?

Sinh thiết khối u là một phần thiết yếu của chăm sóc ung thư. Chúng có thể xác nhận chẩn đoán ung thư, xác định loại tế bào của khối u và ngày càng được sử dụng nhiều hơn để xác định liệu khối u của bệnh nhân có chứa những thay đổi di truyền cụ thể có thể khiến chúng trở thành ứng cử viên cho các liệu pháp nhắm mục tiêu hay không.

Tuy nhiên, sinh thiết khối u yêu cầu các thủ tục xâm lấn, bao gồm cả phẫu thuật và một số bệnh nhân có thể không phù hợp vì sức khỏe kém hoặc do vị trí của khối u trong cơ thể. Ngoài ra, sau khi thử nghiệm ban đầu và phân tích các mẫu sinh thiết, có thể không đủ mô bổ sung để lập hồ sơ phân tử toàn diện hoặc có thể không đủ chất lượng để lập hồ sơ, Tiến sĩ Mack giải thích trong một cuộc họp báo.

Để vượt qua những rào cản này trong việc thu thập thông tin di truyền về bệnh ung thư của bệnh nhân, các nhà nghiên cứu đã phát triển các công nghệ thu thập và phân tích DNA cũng như các loại vật liệu di truyền khác do các tế bào khối u giải phóng vào máu.

Các mẫu tần số và thay đổi tương tự

Nghiên cứu được trình bày tại cuộc họp ASCO đã sử dụng một thử nghiệm được phát triển bởi Guardant Health có trụ sở tại California, được gọi là Guardant360. Thử nghiệm sử dụng giải trình tự thế hệ tiếp theo để phân tích DNA do các tế bào ung thư thải ra, được gọi là DNA khối u tuần hoàn (ctDNA).

Được tài trợ bởi Guardant Health, nghiên cứu đã sử dụng mẫu máu của hơn 15.000 bệnh nhân với hơn 50 loại khối u. Các nhà nghiên cứu đã so sánh liệu xét nghiệm Guardant360, lập hồ sơ ctDNA cho các đột biến và sắp xếp lại nhiễm sắc thể ở 70 gen liên quan đến ung thư, có phát hiện ra những thay đổi ở những gen này ở cùng phân bố và tần số được quan sát thấy trong các nghiên cứu lập hồ sơ gen được công bố trước đây sử dụng các mẫu sinh thiết khối u, bao gồm The Cancer Bản đồ bộ gen.

Và nhìn chung, xét nghiệm sinh thiết lỏng rất phù hợp với các kiểu biến đổi gen được báo cáo trong xét nghiệm mô khối u truyền thống. Ví dụ: Guardant360 đã xác định các đột biến quan trọng tương tự ở các gen quan trọng liên quan đến ung thư như EGFR, BRAF, KRASPIK3CA ở tần số rất giống với tần số đã được xác định trước đó trong các mẫu sinh thiết khối u, tương quan về mặt thống kê từ 94% đến 99%.

Trong phần thứ hai của nghiên cứu, các nhà nghiên cứu đã đánh giá gần 400 bệnh nhân — hầu hết trong số họ bị ung thư phổi hoặc ung thư đại trực tràng — những người có cả kết quả ctDNA máu và DNA mô khối u và so sánh các kiểu thay đổi bộ gen. Độ chính xác tổng thể của sinh thiết lỏng so với kết quả từ các phân tích sinh thiết khối u là 87%. Họ cho biết độ chính xác tăng lên 98% khi các mẫu máu và khối u được thu thập trong vòng 6 tháng.

Tiến sĩ Mack cho biết sinh thiết lỏng hoạt động tốt mặc dù mức độ ctDNA trong hầu hết các mẫu rất thấp, thường dưới 0,4% tổng số DNA lưu thông trong máu. (DNA lưu hành có thể đến từ nhiều nguồn khác ngoài khối u, bao gồm da, tủy xương và đường tiêu hóa.)

Trong các mẫu ctDNA máu/sinh thiết khối u phù hợp, sinh thiết lỏng cũng xác định các biến đổi di truyền không có trong các mẫu sinh thiết khối u được biết là làm cho khối u kháng trị liệu. Chúng bao gồm các đột biến trong gen EGFR , ALKKRAS được biết là gây ra sự kháng thuốc đối với các tác nhân nhắm mục tiêu hiện có.

Nhìn chung, xét nghiệm đã xác định được những đột biến kháng thuốc này ở 27% bệnh nhân, Tiến sĩ Mack cho biết trong một cuộc phỏng vấn. Ông tiếp tục, trong hầu hết các trường hợp, các đột biến có thể không xuất hiện tại thời điểm sinh thiết khối u ban đầu, thay vào đó xuất hiện khi bệnh của bệnh nhân tiến triển trong quá trình điều trị.

Dựa trên những thay đổi di truyền được tìm thấy thông qua các sinh thiết lỏng này, ở gần 2/3 bệnh nhân, các nhà nghiên cứu đã xác định được dấu ấn sinh học khối u có thể cung cấp cho bác sĩ điều trị của bệnh nhân thông tin để có thể giúp hướng dẫn các lựa chọn điều trị. Điều này bao gồm việc xác định những bệnh nhân là ứng cử viên cho các loại thuốc được FDA chấp thuận hoặc đăng ký tham gia các thử nghiệm lâm sàng thử nghiệm các liệu pháp điều tra chống lại những đột biến này.

Điều gì tiếp theo cho sinh thiết lỏng?

Luis Diaz, Jr., MD, thuộc Đại học Johns Hopkins, giải thích trong một phiên về bộ gen lâm sàng tại cuộc họp ASCO, sinh thiết lỏng là một lĩnh vực nghiên cứu mạnh mẽ và hoạt động thương mại.

Tiến sĩ Diaz, người có nghiên cứu tập trung vào các phương pháp chẩn đoán bộ gen cho biết: “Lĩnh vực này đã thực sự bùng nổ.

FDA chấp thuận xét nghiệm sinh thiết lỏng đầu tiên

Vào ngày 1 tháng 6, Cục Quản lý Thực phẩm và Dược phẩm (FDA) đã phê duyệt xét nghiệm sinh thiết lỏng đầu tiên để sử dụng trong ung thư. Thử nghiệm đột biến EGFR v2 của cobus phát hiện các đột biến quan trọng trong gen EGFR khiến bệnh nhân mắc bệnh ung thư phổi không phải tế bào giai đoạn nặng có thể điều trị bằng liệu pháp nhắm mục tiêu erlotinib (Tarceva®). FDA đã phê duyệt thử nghiệm trước đây cho chỉ định này bằng cách sử dụng các mẫu bệnh phẩm khối u. Công dụng mới là để phát hiện các đột biến này trong DNA khối u lưu hành từ các mẫu máu.

Tiến sĩ Mack cho biết: “Hiện tại, các sinh thiết lỏng để lập hồ sơ phân tử toàn diện đã có sẵn cho bệnh nhân và bác sĩ và có thể là một nguồn tuyệt vời để cung cấp thêm thông tin di truyền khối u khi không có sinh thiết mô. “Nhưng nên thận trọng khi giải thích chúng cho đến khi các thử nghiệm lâm sàng được hoàn thành để xác nhận công dụng điều trị của chúng.”

Đối với bệnh nhân ung thư tiến triển, Tiến sĩ Diaz cho rằng các xét nghiệm như vậy có thể có giá trị nhất để giúp theo dõi những thay đổi trong bệnh của bệnh nhân theo thời gian và điều trị trực tiếp khi khối u tái phát hoặc tiến triển. Một số nghiên cứu cũng cho thấy rằng sinh thiết lỏng cuối cùng có thể giúp chăm sóc trực tiếp cho bệnh nhân mắc bệnh ở giai đoạn đầu hoặc giúp theo dõi tiến triển bệnh ở những người có tổn thương tiền ung thư, ông nói.

Richard Schilsky, MD, Đại học Chicago, cho biết trong cuộc họp báo rằng cần có nhiều nghiên cứu hơn trước khi sinh thiết lỏng được sử dụng thường xuyên trong điều trị ung thư. Tiến sĩ Schilsky lưu ý rằng nghiên cứu hiện tại không phải là một thử nghiệm ngẫu nhiên và chưa có bằng chứng nào cho thấy sinh thiết lỏng đang được phát triển hoặc có sẵn trên thị trường cải thiện kết quả của bệnh nhân.

Ông nói: “Chỉ vì một bài kiểm tra có thể được thực hiện, không có nghĩa là nó nên được thực hiện. “Tất cả chúng ta đều có trách nhiệm chứng minh tiện ích lâm sàng thực sự của các xét nghiệm hiện có.”