Dựa trên kết quả của một nghiên cứu mới, NCI đang triển khai một chương trình lâm sàng có tên là ClinOmics, chương trình này sẽ sử dụng các phương pháp tiếp cận bộ gen để giúp hướng dẫn điều trị bệnh nhân ung thư được điều trị tại Trung tâm lâm sàng NIH.

Trong cuộc phỏng vấn này, Javed Khan, MD, thuộc Trung tâm Nghiên cứu Ung thư (CCR) của NCI, thảo luận về triển vọng và thách thức của liệu pháp dựa trên bộ gen đối với trẻ em và người lớn bị ung thư.

Làm thế nào bạn sẽ xác định thuốc chính xác cho trẻ em và thanh niên bị ung thư?

Y học chính xác đề cập đến việc sử dụng trình tự DNA và các loại phân tích “Omic” khác để điều trị phù hợp nhất cho bệnh nhân. Mục tiêu là xác định những cá nhân có khối u có bất thường đặc trưng cho bệnh nhân ung thư mà liệu pháp nhắm mục tiêu tồn tại. Ví dụ, trẻ em mắc bệnh bạch cầu lymphoblastic cấp tính có bất thường di truyền được gọi là nhiễm sắc thể Philadelphia được điều trị bằng thuốc nhắm mục tiêu imatinib (Gleevec®).

Có nhiều bác sĩ sử dụng dữ liệu bộ gen khi lựa chọn phương pháp điều trị cho bệnh nhân trẻ mắc bệnh ung thư?

Một số bác sĩ tại một số bệnh viện đang đưa ra quyết định lâm sàng dựa trên thông tin thu được từ việc lập hồ sơ khối u của bệnh nhân, nhưng điều này phần lớn được thực hiện trên cơ sở đặc biệt. Chúng ta vẫn đang ở giai đoạn đầu của liệu pháp dựa trên bộ gen cho bệnh nhi, mặc dù lĩnh vực này đang phát triển nhanh chóng.

Bạn là đồng tác giả của một nghiên cứu NCI mới thử nghiệm việc sử dụng liệu pháp điều trị bằng gen cho trẻ em và thanh thiếu niên bị ung thư. Bạn đã học được gì?

Nghiên cứu thí điểm của chúng tôi đã thử nghiệm tính khả thi của việc sử dụng xét nghiệm bộ gen của máu và khối u để xác định những thay đổi di truyền có thể đưa ra quyết định điều trị cho 59 trẻ em và thanh niên mắc bệnh ung thư khó chữa hoặc tái phát.

Trong nhóm này, khoảng 50 phần trăm có các đột biến “có thể hành động” về mặt lâm sàng trong khối u—nghĩa là những thay đổi di truyền trong khối u của chính người đó làm thay đổi chẩn đoán của bệnh nhân hoặc có thể được nhắm mục tiêu bằng các loại thuốc hoặc tác nhân được FDA chấp thuận đang được thử nghiệm trong các thử nghiệm lâm sàng hiện có. thử nghiệm. Hai mươi bốn (41 phần trăm) trong số những bệnh nhân này có một đột biến có thể được nhắm mục tiêu bằng một liệu pháp điều tra hoặc đã được phê duyệt. Đáng chú ý, 12 phần trăm bệnh nhân được phát hiện có đột biến dòng mầm đáng kể có thể liên quan đến sự phát triển của bệnh ung thư và quan trọng trong việc quản lý chăm sóc bệnh nhân và gia đình của họ.

Chúng tôi kết luận rằng một phân tích bộ gen toàn diện không chỉ khả thi mà còn có khả năng cải thiện việc chăm sóc cả người lớn và trẻ em bị ung thư. Và trên cơ sở kinh nghiệm này, chúng tôi đang khởi động chương trình CCR ClinOmics.

Bạn có thể vui lòng cho chúng tôi biết về chương trình ClinOmics mới của NCI không?

Đó là một nền tảng bộ gen toàn diện hiện đại để thử nghiệm tất cả bệnh nhân ung thư—cả trẻ em và người lớn—đang được điều trị tại Trung tâm Lâm sàng của Viện Y tế Quốc gia (NIH). Đối với mỗi bệnh nhân, một số loại xét nghiệm bộ gen sẽ được thực hiện trong phòng thí nghiệm được CLIA chứng nhận và kết quả sẽ được nhập vào hồ sơ y tế điện tử của bệnh nhân. Đội ngũ y tế của bệnh nhân có thể truy cập kết quả xét nghiệm và có khả năng sử dụng thông tin để giúp lựa chọn phương pháp điều trị cho bệnh nhân.

Bạn sẽ làm những loại thử nghiệm bộ gen nào?

Chúng tôi sẽ sắp xếp trình tự DNA từ khối u của bệnh nhân, có thể cho thấy những thay đổi di truyền xảy ra trong suốt cuộc đời của bệnh nhân. Chúng được gọi là những thay đổi soma. Chúng tôi cũng sẽ sắp xếp trình tự DNA từ các tế bào mầm của mỗi bệnh nhân, điều này có thể tiết lộ những thay đổi di truyền mà người đó có thể được thừa hưởng. Ngoài ra, chúng tôi sẽ thực hiện các phân tích bộ gen bổ sung như giải trình tự toàn bộ phiên mã (RNAseq) để xác định các gen tổng hợp có thể hành động và các đột biến biểu hiện có thể được nhắm mục tiêu cho liệu pháp.

Ai quyết định những thay đổi di truyền nào có thể liên quan đến điều trị?

Hai nhóm gồm các chuyên gia NCI, một nhóm dành cho những thay đổi về thể chất và nhóm còn lại dành cho những thay đổi về dòng mầm, sẽ xem xét kết quả xét nghiệm bộ gen của từng bệnh nhân để xác định xem có những thay đổi bộ gen có thể thực hiện được hay không. Những phát hiện này sẽ được nhập vào hồ sơ y tế điện tử của bệnh nhân để đội ngũ y tế xem xét.

Tại sao chương trình này được thành lập bây giờ?

Công nghệ này đã phát triển đến mức các xét nghiệm đáng tin cậy và có thể được sử dụng để đưa ra các quyết định lâm sàng. Một xem xét khác là thời gian quay vòng cho kết quả. Các kết quả kiểm tra hiện có sẵn cho các bác sĩ ở định dạng an toàn trong vòng 4 tuần. Khi công nghệ tiến bộ, thời gian quay vòng sẽ sớm chỉ còn 2 tuần.

Bệnh nhân tại NCI sẽ được ghi danh vào chương trình như thế nào?

Các điều tra viên chính trong CCR sẽ mở các giao thức lâm sàng sẽ sử dụng chương trình ClinOmics cho bệnh nhân có khối u ở người lớn và trẻ em. Bệnh nhân đã được điều trị tại Trung tâm Lâm sàng NIH sẽ cần phải đăng ký vào một phác đồ lâm sàng tại Trung tâm Lâm sàng để tham gia.

Một số thách thức liên quan đến liệu pháp dựa trên bộ gen cho trẻ em bị ung thư là gì?

Các nghiên cứu gần đây đã chỉ ra rằng, mặc dù có thể tạo ra một lượng lớn dữ liệu bộ gen từ các bệnh nhân nhi, nhưng hầu hết các dữ liệu này hiện không thể chuyển thành các khuyến nghị điều trị. Các nghiên cứu cũng gợi ý rằng các khối u ở trẻ em có thể có ít đột biến hơn so với các khối u ở người lớn và do đó, có thể có ít biến đổi di truyền có thể tác động hơn. Tuy nhiên, nghiên cứu của chúng tôi và những nghiên cứu khác đã chỉ ra rằng trẻ em và thanh niên mắc bệnh ung thư khó chữa, di căn hoặc tái phát có số lượng đột biến có thể hành động cao hơn.

Có phải khả năng kháng các liệu pháp điều trị ung thư nhắm mục tiêu là một vấn đề đối với bệnh nhân nhi?

Đúng. Ở cả trẻ em và người lớn, khối u thay đổi theo thời gian và thuốc có thể ngừng hoạt động khi khối u có những thay đổi di truyền mới. Sức đề kháng có thể phát triển rất nhanh. Để giải quyết vấn đề kháng thuốc, các thử nghiệm lâm sàng trong tương lai sẽ phải đánh giá các liệu pháp kết hợp hoặc dựa trên miễn dịch – ngay cả đối với những bệnh nhân có khối u chứa biến đổi gen mà liệu pháp nhắm mục tiêu đã tồn tại.

Chương trình ClinOmics có giúp đóng góp vào những tiến bộ trong nghiên cứu ung thư không?

Chương trình sẽ tạo ra một kho lưu trữ mô khối u được thu thập từ các bệnh nhân có thể được sử dụng cho mục đích nghiên cứu. Điều này sẽ cho phép các nhà điều tra phát triển các mô hình ung thư như xenograft có nguồn gốc từ bệnh nhân hoặc PDX. Ngoài ra, bệnh nhân trong chương trình sẽ được theo dõi theo thời gian. Điều này có nghĩa là trong tương lai chúng ta sẽ có thể đặt câu hỏi nghiên cứu chi tiết về những bệnh nhân này, chẳng hạn như liệu những thay đổi di truyền nhất định có liên quan đến phản ứng với các liệu pháp cụ thể hay không.

Có thông điệp chính nào về liệu pháp điều trị bằng bộ gen dành cho bệnh nhân trẻ tuổi và gia đình của họ không?

Điều thực sự quan trọng đối với những bệnh nhân mắc bệnh ung thư đe dọa đến tính mạng là khối u và các tế bào bình thường của họ được định hình bằng các xét nghiệm bộ gen. Tôi nghĩ rằng những xét nghiệm này nên là tiêu chuẩn chăm sóc cho tất cả bệnh nhân mắc bệnh ung thư có nguy cơ cao và đây sẽ là trường hợp của những người đến NCI. Đó có vẻ là một tuyên bố mạnh mẽ, nhưng tôi nghĩ hầu hết các chuyên gia sẽ đồng ý rằng chúng ta đang đi theo hướng đó.